Entre 2009-12, Roger Federer fue uno de los jugadores que venció en Caja Mágica en Madrid, ganando dos títulos y jugando en otra final y la semifinal. Sin embargo, el suizo tuvo que terminar una buena racha en 2013, destronado por Kei Nishikori en la tercera ronda después de que los japoneses obtuvieron un triunfo 6-4, 1-6, 6-2 en una hora y 35 minutos.

Fue su segundo encuentro y la primera victoria para Kei, quien dejó el segundo set detrás de él y comenzó de nuevo en el decisivo, cruzando la línea de meta primero a pesar de ganar siete puntos menos que Roger. El suizo jugó mejor tanto en el primer como en el segundo servicio, pero no fue suficiente para llevarlo a casa, desperdiciando cinco de siete oportunidades de descanso y sufriendo tres descansos para impulsar al rival por la cima y perder la oportunidad de luchar por otra corona en Madrid después de conquistarlo sobre arcilla azul hace un año.

Federer tuvo más ganadores pero también más errores forzados, con aproximadamente el mismo número de errores no forzados en sus cuentas. Estuvieron codo a codo en las manifestaciones más extendidas, con Roger forjando la ventaja en el rango más corto de hasta cuatro golpes, aunque no fue suficiente para asegurar la victoria para él.

Los suizos se mantuvieron enamorados en los juegos uno y tres, pero Kei estaba allí para pelear, disparando a un ganador de derecha a 2-2 para tomar un descanso y moverse al frente. Los japoneses confirmaron la ventaja con otro ganador de derecha, manteniéndose en 15 en el juego diez para llevarse el primer partido 6-4 en media hora.

Kei salvó dos oportunidades de quiebre en el segundo juego del segundo set con ganadores, con Federer convirtiendo el cuarto en el juego cuatro para abrir el liderato y moviéndose 4-1 al frente después de dos ganadores en servicio propio en deuce. Con el impulso de su lado, Federer tomó otro descanso y cerró el set con cuatro ganadores en el juego siete, ganando impulso por delante del decisivo.

Allí, Nishikori aseguró un descanso en el cuarto juego cuando Federer conectó un golpe de derecha, forzando un error de Roger para abrir una brecha de 4-1 y aguantando el amor en el juego siete para mantenerse al frente. Sirviendo para permanecer en el partido, Federer se rompió a los 15 minutos unos minutos después, empujando a su oponente a los cuartos y no logrando alcanzar al menos los últimos cuatro en Madrid por primera vez desde que el evento se trasladó a tierra batida en Caja Mágica.